Очистка мембран проводится для удаления отложений на поверхности мембраны, восстановления и повышения её проницаемости, что можно рассматривать как обратный процесс загрязнения мембраны. Эффективная очистка мембран не только обеспечивает непрерывную работу системы, но и предотвращает возникновение необратимого загрязнения, тем самым продлевая срок службы мембран и снижая эксплуатационные расходы. Важно отметить, что некоторые вещества в поступающей воде могут вступать в химическую реакцию с поверхностью мембраны, вызывая осадкообразование и старение поверхности мембраны, что приводит к её загрязнению или ухудшению производительности.