Свойства мембраны относятся к физическим и химическим характеристикам материала мембраны, включая поверхностный заряд, гидрофильность, гидрофобность, размер пор и шероховатость поверхности. Эти свойства в различной степени влияют на уровень загрязнения мембраны. Основными факторами загрязнения, вызванного материалом мембраны, являются: адсорбционное взаимодействие, связанное со свободной поверхностной и межфазной энергией между мембраной и раствором, явление смачивания раствора на поверхности мембраны, устойчивость материала мембраны к загрязнению, гидрофильность и т.д. Адсорбционное загрязнение мембраны является наиболее распространенным типом загрязнения, вызванного взаимодействием между материалом мембраны и раствором.

Основная причина адсорбционного загрязнения заключается в том, что когда поверхность мембраны адсорбирует молекулы со схожей полярностью, межфазное натяжение в адсорбционном слое невелико, что позволяет адсорбционному слою на поверхности мембраны стабильно существовать. Природа молекул на поверхности мембраны, их конденсированное состояние и полярность источника загрязнения напрямую определяют адсорбционное загрязнение. Неспецифические силы, вызывающие адсорбцию загрязнителей на поверхности мембраны, включают: электростатические взаимодействия, гидрофобные взаимодействия, силы Ван-дер-Ваальса и водородные связи. Силы Ван-дер-Ваальса и водородные связи между молекулами совместно влияют на полярность мембраны. Полярность поверхности мембраны также можно описать через явление смачивания.

Кроме того, гидрофильность/гидрофобность мембраны также является важным фактором, влияющим на загрязнение. Обычно считается, что мембраны с сильной гидрофильностью могут уменьшить образование загрязнения. Зарубежные ученые, сравнивая гидрофильные и гидрофобные материалы в экспериментах с нанофильтрацией, пришли к выводу, что снижение потока у мембран из гидрофобных материалов более серьезное, чем у гидрофильных, наблюдается более сильное загрязнение с образованием плотного слоя осадка на поверхности мембраны. Материалы мембран с сильной гидрофильностью обычно характеризуются краевым углом смачивания на поверхности мембраны. Считается, что чем меньше краевой угол, тем выше гидрофильность поверхности мембраны, что проявляется в явлении смачивания.